SCP基金會是一个不受任何政府干涉的神秘组织，致力于收容和研究各类超自然、高危异常实体。主人公陆雲以D級實驗對象的身份加入基金會，在充满死亡威胁的SCP收容设施中挣扎求生。他意外获得特殊能力，逐步揭开基金會深藏的黑暗真相：从SCP-914的失控实验到“收容失效”的全球危机，从基金会高层的权力博弈到异界维度的恐怖渗透。随着陆雲晋升至特工阶层，他发现自己卷入了一场跨越现实与虚幻的终极战争——对抗名为“Kondraki”的古老存在，以及试图打破次元壁的克苏鲁势力。在第676章的大结局中，陆雲以基金会首席研究员的身份，用“收容协议000”封印了所有维度裂缝，却发现自己早已成为SCP-XXXX，一个被写入基金会编年史的活体异常。